Population humaine et génétique évolutive

Description

Presque vingt ans après le séquençage du génome humain, une multitude de données génomiques a permis de décrire la diversité génétique humaine à un niveau de résolution sans précédent. Des projets internationaux tels que le Projet 1000 Génomes, le Consortium Exome Aggregation, ou UK Biobank ont fourni des informations cruciales pour comprendre l’architecture génétique des maladies et phénotypes de l’homme. Ces données massives ont également amélioré notre compréhension de la démographie de notre espèce, incluant en particulier comment les populations humaines se sont dispersées autour du globe, comment leur taille a changé au cours du temps, et à quel point elles se sont métissées.

Dans ce contexte, la détection des signatures moléculaires de la sélection naturelle dans le génome humain a été fondamentale pour l’identification des gènes à l’origine de la diversité morphologique et physiologique observée entre populations humaines actuelles, et pour notre compréhension de l’architecture génétique des phénotypes adaptatifs.L’objectif de ce MOOC est de donner les bases fondamentales de la génétique des populations appliquée à notre espèce, et de l’illustrer par de nombreux exemples provenant de la recherche. Nous décrirons les différents facteurs qui déterminent notre diversité génétique, incluant la mutation, la recombinaison, la dérive génétique, et la sélection naturelle.

Format

Le MOOC est divisé en 4 chapitres de 5 à 8 sessions. Chaque session comporte une vidéo de 8 à 10 minutes en moyenne et de 2 questions à choix multiple pour tester votre compréhension de la session. A la fin de chaque chapitre, 10 à 16 questions à choix multiple vous seront posées, suivies d’une évaluation finale et d’un examen de certification.
Les videos sont en anglais, sous-titrées en anglais et en français.

Pour suivre ce cours, vous avez le choix entre deux formules
Formule découverte
Si vous optez pour cette formule, vous aurez accès aux vidéos du cours, aux QCMs après chaque session, et aux échanges dans le Forum. A l’issue de la formule Découverte vous aurez acquis des connaissances approfondies sur la Génétique des populations et l’évolution humaine depuis son apparition.
Formule Qualifiante.
Si vous optez pour cette formule, vous aurez, en plus des activités proposées dans la formule Découverte, un quiz à la fin de chaque chapitre et à la fin du MOOC, trois hangouts au cours de la diffusion du MOOC, une vidéo de conclusion à la fin de la période de diffusion, et un examen individuel final surveillé à distance. Le succès à l’examen vous permettra d’obtenir un certificat délivré par FUN et par l’Institut Pasteur.
Le prix de l’inscription à la formule Qualifiante est de 150€.
Pour vous inscrire à la formule qualifiante, et donc être capable de suivre la totalité des sessions, de participer efficacement aux discussions des hangouts et de réussir l’examen final, vous devrez absolument avoir un niveau scientifique suffisant correspondant au moins à une licence en sciences de la vie.

Prérequis

Pour la formule qualifiante, le succès à l’examen vous permettra d’obtenir un certificat délivré par FUN et par l’Institut Pasteur.

Evaluation et Certification

Pour la formule qualifiante, le succès à l’examen vous permettra d’obtenir un certificat délivré par FUN et par l’Institut Pasteur.

Plan de cours

Chapitre 1 – Diversité du génome humain et génétique des populations
- Diversité du génome humain
- Bases de données de variations génétiques des populations
- Engagement public et retour aux populations
- Facteurs déterminant la diversité génétique: mutation et recombinaison
- Facteurs déterminant la diversité génétique : dérive génétique
- Facteurs déterminant la diversité génétique : sélection naturelle
Chapitre 2 – L’histoire démographique des populations humaines - Diversité du génome humain et génétique des populations
- Méthodes d’inférence démographique
- Séparations et métissages des populations humaines
- Histoire génétique du continent Africain
- Histoire génétique du continent Européen
- Histoire génétique de l’Asie, l’Australie et l’Océanie
- Histoire génétique des Amériques
- L’utilisation de pathogènes comme marqueurs des migrations humaines
- Inférence des pratiques culturelles à travers la génétique.
Chapitre 3 – Histoire de l’adaptation des populations humaines
- Diversité du génome humain
- Méthodes de détection de la sélection naturelle
- Les effets de la sélection purificatrice sur le génome des populations humaines
- Adaptation aux ressources nutritionnelles
- Adaptation au climat et aux conditions extrêmes
- Adaptation aux agents pathogènes et aux maladies infectieuses
- Les modèles alternatifs de l’adaptation
Chapitre 4 – Contribution de l’étude de l’ancien ADN à l’évolution humaine
- Méthodes en paléogénomique
- Les homininés archaïques et leur métissage avec les humains modernes
- Histoire récente à travers la loupe de l’ADN ancien
- L’héritage phénotypique du métissage archaïque
- La nature adaptative de l’introgression archaïque